Gdy polimer antygenu O zostanie połączony z rdzeniem lipidu A, zatrzyma reakcję polimeryzacji. Oznacza to, że reakcja łączenia może zakończyć reakcję polimeryzacji. Zarówno rdzeń lipidu A, jak i lipopolisacharyd o powtarzalnych jednostkach o różnej długości mogą być skutecznie przenoszone na błonę zewnętrzną. Dlatego wielkość cząsteczkową lipopolisacharydu można zobaczyć za pomocą SDS-PAGE, co jest spowodowane raczej różnicą w systemie biosyntezy niż czynnikiem systemu wyjściowego.

Rozmieszczenie łańcucha bocznego antygenu O w różnych bakteriach jest różne, z których niektóre zawierają około 20 powtórzonych jednostek, a niektóre z nich mogą mieć około 100 powtórzonych jednostek. W elektroforezie SDS-PAGE odzwierciedla się różnicę w intensywności barwienia srebrem różnych cząsteczek różnych gatunków bakterii. Przyczyną różnej dystrybucji długości łańcucha bocznego antygenu O u różnych bakterii może być czynnik selekcji wielkości w procesie polikondensacji lub reakcji łączenia antygenu O. Wzz (tj. Rol lub Cld) jest ważnym białkiem, które reguluje rozkład długości łańcuchów bocznych u bakterii syntetyzujących antygeny poprzez szlak zależny od Wzy, ale jego specyficzny mechanizm jest nadal niejasny.